金沙遗址博物馆是成都博物院管理的正县级事业单位，内设办公室、陈列研究部、宣传营销部三大机构。
办公室工作职能：
　　（1）负责馆内的行政、党务、人事、财务、票务、保卫、接待、后勤及综合协调等日常管理工作。
　　（2）负责馆内的经营管理、宣传营销策划、文化产业等工作。
　　（3）负责各部门的综合协调。
　　（4）负责上级交办的其他各项工作。
陈列研究部工作职能：
　　（1）负责藏品征集并对藏品进行日常保护、管理与建档、建卡工作。
　　（2）对藏品进行整理与研究，为陈列展示提供学术保障。
　　（3）努力扩大研究成果，为陈列展览、宣传及品牌营销提供学术支撑。
　　（4）负责金沙遗址博物馆陈列展览工作，制定展览规划并组织实施。
　　（5）负责本馆日常讲解接待工作。
宣传营销部工作职能：
　　（1）负责金沙遗址博物馆对外宣传工作。
　　（2）负责广告投放和促销方案的制定审核、实施。
　　（3）负责招商手册和方案的制定、实施。
　　（4）负责本馆网站日常运转、编辑、维护等工作，积极宣传金沙文化。
　　（5）承担爱国主义教育和未成年人思想道德教育工作。